蜂蜜應置於室內陰涼處，環境溫度太高容易造成HMF的快速累積，影響品質。最好也不要放在冰箱冷藏，容易造成蜂蜜結晶，蜂蜜開封後應將瓶蓋旋緊，以避免吸濕回潮造成發酵變質，開封後最好在短時間內食用完畢，因為容器內的空氣仍可能使蜂蜜含水量增加。蜂蜜中的含水率影響保存的時間，一般新採收的蜂蜜，因含水率常超過23％以上，是不耐貯存的，應儘快在2個星期內吃完，當水分在20％以內，蜂蜜可較長期保存，一般可貯存二年，風味仍佳，只是顏色會變深。

一般不推薦一歲以下幼兒吃蜂蜜，主要是因幼兒腸道尚未發育完全，對肉毒桿菌無抵抗力，因蜂蜜一般都未經完全殺菌處理，因此在安全考量下是不作推薦，台灣養蜂協會曾進行二年抽檢各地的蜂蜜，委託學術單位檢測均未檢測出含肉毒桿菌。

蜂蜜是蜜蜂採集植物花朵或腋芽處之花蜜帶回巢，經濃縮釀造而成黏綢狀的甜液，其中含糖類75～80%，主要為單糖類（果糖及葡萄糖），並含多種酵素、維生素、礦物質等。而蔗糖（或稱砂糖）是由甘蔗和甜菜汁液所提煉的，主要成份為蔗糖（多糖），其他成份很少。果糖糖漿，是將澱粉類（如玉米粉、樹薯粉等）利用各種糖化酵素將其分解成含糖溶液，再經濃縮而成。

糖尿病係因體內胰臟產生的胰島素不足，或效應相對降低所造成，無法將體內的葡萄糖轉化為肝糖貯存體內，使血液的葡萄糖增加，因此糖尿病病患控制飲食中的糖類（碳水化合物）是必要的，蜂蜜雖然也含很高的糖類，主要以單糖類的葡萄糖和果糖為主(約各佔35~40%)，二種單糖在體內的吸收時間不同，不致在短時間內造成過高血糖，其中葡萄糖吸收最快，在胃壁即被吸收，而果糖吸收較慢，到小腸才被吸收利用，分解吸收過程也並不依賴胰島素，因此在有限度的控制下，食用蜂蜜是被允許的。